Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms