Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP5P51878 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP5P51878 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP5P51878 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP5P51878 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP5P51878 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms