Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms