Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSEN1P49768 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms