Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRXP46100 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms