Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A2P43354 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms