Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3CBP42338 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms