Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms