Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM23P36406 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms