Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPB2P35606 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPB2P35606 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms