Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms