Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTF4P34130 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF4P34130 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF4P34130 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTF4P34130 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTF4P34130 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms