Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC27P30260 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC27P30260 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms