Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHC1P29353 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHC1P29353 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms