Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHATP28329 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHATP28329 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHATP28329 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHATP28329 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms