Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSFA2P28290 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms