Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA4P25789 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms