Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms