Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APCP25054 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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APCP25054 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCP25054 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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APCP25054 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCP25054 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCP25054 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCP25054 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCP25054 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCP25054 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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