Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms