Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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