Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms