Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKACBP22694 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms