Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2P22307 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2P22307 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2P22307 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2P22307 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2P22307 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2P22307 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2P22307 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2P22307 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms