Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASTP20810 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASTP20810 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASTP20810 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASTP20810 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms