Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms