Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms