Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCN1P20061 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCN1P20061 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCN1P20061 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TCN1P20061 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TCN1P20061 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCN1P20061 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms