Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms