Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTSLP07711 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSLP07711 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTSLP07711 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSLP07711 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms