Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms