Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms