Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYBBP04839 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYBBP04839 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYBBP04839 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYBBP04839 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms