Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC1P02654 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC1P02654 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC1P02654 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms