Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms