Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1AO95602 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms