Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms