Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms