Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms