Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC45O75419 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC45O75419 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms