Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms