Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms