Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms