Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHL1O00533 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHL1O00533 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHL1O00533 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHL1O00533 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHL1O00533 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHL1O00533 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHL1O00533 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHL1O00533 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms