Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLRMTO00411 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms