Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIP1O00291 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms