Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms