Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KR12 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KR12 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KR12 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms