Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL1BA8MQ27 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL1BA8MQ27 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms