Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GMNCA6NCL1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms